„Flipper“ erzählt die Geschichte von Sandy, der mit seiner Familie in einem Küstenort in Florida lebt. Nachdem ein Hurrikan den Ort verwüstet und Sandys Vater auf das Festland muss, übernimmt Sandy die Hausarbeiten. Sandy, geprägt von den Lehren seines Vaters über das Wohl der Tiere, rettet und pflegt den Delfin, den sie Flipper nennen, zuhause. Trotz der anfänglichen Wut seines Vaters, zeigt Flipper eine besondere Fähigkeit, Fischschwärme zu finden, was der Familie hilft.